Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SSPNQ14714 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms