Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMC1AQ14683 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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