Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RUNX3Q13761 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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