Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TCIRG1Q13488 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TCIRG1Q13488 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20■□□□□ 0.79
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