Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K1Q13233 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K1Q13233 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms