Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DUSP4Q13115 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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