Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAF1Q13077 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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TRAF1Q13077 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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TRAF1Q13077 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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TRAF1Q13077 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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TRAF1Q13077 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF1Q13077 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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