Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
STRN3Q13033 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms