Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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FOXD4Q12950 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FOXD4Q12950 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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