Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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KCNMA1Q12791 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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KCNMA1Q12791 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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KCNMA1Q12791 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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KCNMA1Q12791 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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KCNMA1Q12791 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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KCNMA1Q12791 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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KCNMA1Q12791 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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KCNMA1Q12791 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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KCNMA1Q12791 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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KCNMA1Q12791 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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KCNMA1Q12791 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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KCNMA1Q12791 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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