Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FOXO1Q12778 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FOXO1Q12778 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FOXO1Q12778 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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