Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP160Q12769 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP160Q12769 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
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