Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms