Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms