Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
POLEQ07864 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
POLEQ07864 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
POLEQ07864 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms