Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNG1Q06432 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms