Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DEUP1Q05D60 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms