Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CREMQ03060 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CREMQ03060 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CREMQ03060 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CREMQ03060 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CREMQ03060 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CREMQ03060 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CREMQ03060 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CREMQ03060 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CREMQ03060 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CREMQ03060 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREMQ03060 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREMQ03060 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREMQ03060 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREMQ03060 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREMQ03060 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREMQ03060 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREMQ03060 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREMQ03060 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREMQ03060 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREMQ03060 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREMQ03060 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREMQ03060 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREMQ03060 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CREMQ03060 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms