Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HERVK_113P61574 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms