Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARF3P61204 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ARF3P61204 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms