Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DCDC1P59894 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms