Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NRG3P56975 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NRG3P56975 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NRG3P56975 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms