Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ALDH9A1P49189 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH9A1P49189 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH9A1P49189 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH9A1P49189 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH9A1P49189 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH9A1P49189 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH9A1P49189 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH9A1P49189 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH9A1P49189 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH9A1P49189 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH9A1P49189 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH9A1P49189 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ALDH9A1P49189 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH9A1P49189 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH9A1P49189 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH9A1P49189 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALDH9A1P49189 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms