Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRA4P48169 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms