Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms