Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMPOP42166 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMPOP42166 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMPOP42166 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMPOP42166 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPOP42166 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMPOP42166 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPOP42166 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMPOP42166 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms