Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
APOBEC1P41238 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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