Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP12P39900 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP12P39900 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP12P39900 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP12P39900 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP12P39900 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP12P39900 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP12P39900 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP12P39900 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP12P39900 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP12P39900 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP12P39900 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP12P39900 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP12P39900 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP12P39900 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP12P39900 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP12P39900 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP12P39900 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP12P39900 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP12P39900 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MMP12P39900 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP12P39900 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP12P39900 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP12P39900 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP12P39900 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP12P39900 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP12P39900 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP12P39900 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP12P39900 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP12P39900 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP12P39900 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP12P39900 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP12P39900 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MMP12P39900 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MMP12P39900 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MMP12P39900 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms