Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPN7P35236 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPN7P35236 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms