Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRMP28827 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRMP28827 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms