Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DUSP1P28562 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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