Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms