Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLD1P28340 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POLD1P28340 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POLD1P28340 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POLD1P28340 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms