Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USF1P22415 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
USF1P22415 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
USF1P22415 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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