Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ITGB6P18564 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms