Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms