Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AL009172.1-201ENST00000436365 1098 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 NSMCE2-208ENST00000520866 1183 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AP003122.2-201ENST00000527332 486 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC018362.2-202ENST00000567089 562 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AC106872.6-201ENST00000514228 1346 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HOXB1P14653 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 IL22-202ENST00000538666 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AC027020.1-201ENST00000559349 632 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HOXB1P14653 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms