Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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PKHD1P08F94 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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PKHD1P08F94 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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PKHD1P08F94 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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PKHD1P08F94 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PKHD1P08F94 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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