Protein–RNA interactions for Protein: P07359

GP1BA, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BAP07359 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BAP07359 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms