Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLK3P07288 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLK3P07288 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLK3P07288 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLK3P07288 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLK3P07288 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLK3P07288 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms