Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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CLDN9O95484 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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CLDN9O95484 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CLDN9O95484 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CLDN9O95484 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CLDN9O95484 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CLDN9O95484 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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CLDN9O95484 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CLDN9O95484 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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