Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms