Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF4O60810 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms