Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNMO15061 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNMO15061 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNMO15061 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNMO15061 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNMO15061 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNMO15061 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNMO15061 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNMO15061 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNMO15061 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNMO15061 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNMO15061 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNMO15061 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNMO15061 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNMO15061 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNMO15061 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNMO15061 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNMO15061 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNMO15061 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNMO15061 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNMO15061 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNMO15061 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNMO15061 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNMO15061 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNMO15061 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNMO15061 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNMO15061 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNMO15061 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNMO15061 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNMO15061 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms