Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms