Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRIT2A6NDA9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.3 ms