Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSDA5PKW4 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms