Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KNSTRNQ9Y448 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KNSTRNQ9Y448 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms