Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DTX4Q9Y2E6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms