Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VPS4AQ9UN37 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VPS4AQ9UN37 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms